19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2345 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2345  VanZ family protein  100 
 
 
444 aa  849    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0107  VanZ family protein  38.66 
 
 
1122 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2545  VanZ family protein  38.89 
 
 
487 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29551  normal  0.0372362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1547  VanZ family protein  37.91 
 
 
1131 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2429  hypothetical protein  30.95 
 
 
1089 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2514  VanZ like protein  32.34 
 
 
1119 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  30.67 
 
 
1200 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0208  hypothetical protein  31.84 
 
 
773 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4646  hypothetical protein  31.15 
 
 
494 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.387775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  32.17 
 
 
351 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  26.71 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  24.4 
 
 
216 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  26.71 
 
 
212 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  25.34 
 
 
212 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  25.69 
 
 
211 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  24.4 
 
 
216 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  26.72 
 
 
212 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  27.01 
 
 
208 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  28.87 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>