43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4156 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  100 
 
 		 351 aa  673    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  36.8 
 
 		 364 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  34.66 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  35.77 
 
 		 421 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  35.49 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  40.58 
 
 		 375 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  36.9 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  32.39 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  34.65 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  34.99 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  39.09 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  39.09 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  39.09 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  34.07 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  33.71 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  34.35 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  37.11 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  32.56 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  34.63 
 
 		 403 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  34.35 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  38.95 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  36.93 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  36.83 
 
 		 383 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  37.39 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  32.87 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  35.26 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  30.23 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  53.64 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  34.63 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  32.69 
 
 		 399 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  32.69 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  34.64 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  33.06 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  38.35 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  36.84 
 
 		 142 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  42.02 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  29.45 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  46.07 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  49.5 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2345  VanZ family protein  32.17 
 
 		 444 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4646  hypothetical protein  37.5 
 
 		 494 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.387775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1547  VanZ family protein  42.47 
 
 		 1131 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0107  VanZ family protein  34.78 
 
 		 1122 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>