41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0172 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  100 
 
 		 421 aa  821    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  98.57 
 
 		 421 aa  811    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  83.46 
 
 		 408 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  61.48 
 
 		 416 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  62.16 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  43.98 
 
 		 383 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  43.68 
 
 		 383 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  43.68 
 
 		 383 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  43.68 
 
 		 383 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  44.5 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  44.64 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  44.75 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  43.88 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  44.59 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  45.48 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  42.39 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  43.19 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  44.75 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  44.65 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  43.5 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  43.5 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  37.9 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  34.9 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  37.92 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  35.75 
 
 		 371 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  33.71 
 
 		 364 aa  144  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  35.69 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  35.54 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  33.15 
 
 		 377 aa  126  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  35.31 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  35.71 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  35.71 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  34.83 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  31.78 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  45.04 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  37.67 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  41.22 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  39.47 
 
 		 142 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  33.59 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  35.03 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2429  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1089 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551586  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>