41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0382 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  100 
 
 		 377 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  69.35 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  70.99 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  70.99 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  57.58 
 
 		 364 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  57.62 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  67.2 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  56.25 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  58.62 
 
 		 371 aa  325  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  44.35 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  44.35 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  32.6 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  35.18 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  33.8 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  34.07 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  36.21 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  36.21 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  36.21 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  36.94 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  35.57 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  35.18 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  35.26 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  34.08 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  35.81 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  36.01 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  42.11 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  34.21 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  32.96 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  41.61 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  39.31 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  30.79 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  39.85 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  36.89 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  33.43 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  41.38 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  41.38 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  42.59 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  42.59 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  42.59 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  41.3 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1547  VanZ family protein  38.28 
 
 		 1131 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>