42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6239 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  100 
 
 
383 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  93.47 
 
 
383 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  93.47 
 
 
383 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  93.47 
 
 
383 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  90.86 
 
 
383 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  91.12 
 
 
383 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  90.08 
 
 
383 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  71.35 
 
 
397 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  72.97 
 
 
403 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  73.24 
 
 
403 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  72.97 
 
 
397 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  70.54 
 
 
393 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  70.54 
 
 
399 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  65.68 
 
 
386 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  61.97 
 
 
385 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  62.77 
 
 
385 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  46.79 
 
 
440 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  47.04 
 
 
416 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  66.95 
 
 
248 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  43.95 
 
 
408 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  44.15 
 
 
421 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  43.88 
 
 
421 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  36.84 
 
 
364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  34.68 
 
 
364 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  37.3 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  38.31 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  36.36 
 
 
377 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  36.29 
 
 
372 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  36.09 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  34.33 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  44.44 
 
 
384 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  34.37 
 
 
368 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  38.29 
 
 
365 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  38.29 
 
 
365 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  35.64 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  44.74 
 
 
142 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  37.98 
 
 
403 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  36.92 
 
 
429 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  53.06 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  37.98 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0115  VanZ family protein  32.93 
 
 
150 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.409766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  36.03 
 
 
136 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>