28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1880 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  100 
 
 		 136 aa  263  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0245  hypothetical protein  53.4 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2594  VanZ like protein  47.06 
 
 		 195 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2623  VanZ like protein  37.5 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  44.3 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  34.18 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  38.24 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  36.05 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  31.71 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  31.71 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  29.27 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  32.35 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1519  VanZ family protein  43.1 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000017636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4942  hypothetical protein  30.49 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  31.91 
 
 		 408 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5488  hypothetical protein  30.49 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5097  hypothetical protein  30.49 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4927  hypothetical protein  30.49 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5337  hypothetical protein  30.49 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  42.19 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  36.92 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  24.78 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  30.49 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  31.08 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  23.33 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  33.04 
 
 		 416 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>