14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3020 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  59.84 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0145  hypothetical protein  55.64 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  55.66 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0750  hypothetical protein  40.56 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  33.33 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  26.53 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  26.6 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  26.17 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3080  hypothetical protein  28.57 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.731573  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  24.63 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  24.78 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  27.69 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  34.31 
 
 		 134 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>