50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0123 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  100 
 
 
165 aa  331  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  30.94 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  30.99 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  33.09 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  33.02 
 
 
141 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  31.65 
 
 
148 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  28.65 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  28.07 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  29.5 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  34.18 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  29.25 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  31.82 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  35.79 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  29.73 
 
 
161 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3359  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  29.77 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  29.73 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  29.73 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  31.03 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  34.57 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  31.63 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  30.68 
 
 
140 aa  44.3  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  44.74 
 
 
109 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  32.94 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  28.1 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  35.71 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  35.71 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5097  hypothetical protein  27.22 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4927  hypothetical protein  27.22 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5337  hypothetical protein  27.22 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5488  hypothetical protein  27.22 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2623  VanZ like protein  33.33 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  35.71 
 
 
120 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  31.76 
 
 
119 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  29.47 
 
 
150 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  32.14 
 
 
142 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4942  hypothetical protein  27.22 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2594  VanZ like protein  37.5 
 
 
195 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  28.92 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  29.41 
 
 
126 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  33.73 
 
 
120 aa  40.8  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0857  VanZ family protein  28.36 
 
 
116 aa  40.8  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.34815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  32.88 
 
 
147 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  35.71 
 
 
120 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  35.71 
 
 
120 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  34.83 
 
 
116 aa  40.8  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  35.71 
 
 
120 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>