40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4454 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  100 
 
 
155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  53.9 
 
 
156 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  41.55 
 
 
160 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  41.91 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  40.74 
 
 
175 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  34.44 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  33.99 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  31.79 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  31.79 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  36.57 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5097  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5337  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5488  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4927  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  32.76 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  30.46 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4942  hypothetical protein  30.46 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  34.31 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  32 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  31.82 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1708  integral membrane protein-like protein  28.66 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  31.06 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  36.08 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  34.15 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  33.09 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3602  VanZ family protein  37.19 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1277  integral membrane protein  27.27 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1259  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1783  integral membrane protein-like protein  25.17 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  52.27 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1724  integral membrane protein-like protein  32.47 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0743  hypothetical protein  38.16 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000269716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3359  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0245  hypothetical protein  36.67 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  34.29 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2594  VanZ like protein  35 
 
 
195 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  37.5 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0345  integral membrane protein-like protein  26.67 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  31.08 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>