29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11940 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  100 
 
 		 160 aa  327  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  43.61 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  44.86 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  31.82 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  30.14 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  36.05 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  31.85 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  32.84 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  32.21 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  28.47 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0857  VanZ family protein  30.95 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.34815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  26.53 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  41.33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  30.94 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1519  VanZ family protein  45.61 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000017636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3359  hypothetical protein  31.82 
 
 		 203 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  42.31 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  31.76 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  27.21 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  36.05 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  45.83 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  26.14 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  26.14 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  26.99 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1489  VanZ family protein  31.25 
 
 		 144 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  25.62 
 
 		 161 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2594  VanZ like protein  29.07 
 
 		 195 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  25.62 
 
 		 161 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0245  hypothetical protein  37.88 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>