33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3166 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  100 
 
 
147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  64.79 
 
 
150 aa  192  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  42.27 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  31.62 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  34.31 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  36.05 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  41.94 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  31.88 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  35.07 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  30.77 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  36.11 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  29.41 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1277  integral membrane protein  32.26 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  26.38 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  28.85 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  28.85 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1259  hypothetical protein  29.56 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  31.85 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  29.13 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  29.13 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  24.54 
 
 
161 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  51.28 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  33.03 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0743  hypothetical protein  26.14 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000269716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3602  VanZ family protein  42.67 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  31.76 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5337  hypothetical protein  28.16 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5488  hypothetical protein  28.16 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4927  hypothetical protein  28.16 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5097  hypothetical protein  28.16 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0857  VanZ family protein  39.58 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.34815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  32.88 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1519  VanZ family protein  37.93 
 
 
132 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000017636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>