37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0005 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  41.94 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  40.24 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  41.38 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  36.08 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  41.1 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  41.33 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  34.09 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  35.11 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  33.02 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  33.33 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  31.63 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  32.08 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  35.62 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  35.14 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  38.75 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  34.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  36.9 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  34.29 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1519  VanZ family protein  41.27 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000017636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  33.66 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  35.9 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  51.43 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  35.9 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  31 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  36.49 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  33.77 
 
 		 116 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2623  VanZ like protein  35 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  29.13 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0857  VanZ family protein  36.73 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.34815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5337  hypothetical protein  35.9 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5488  hypothetical protein  35.9 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4927  hypothetical protein  35.9 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5097  hypothetical protein  35.9 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>