35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0088 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  100 
 
 		 148 aa  300  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  41.91 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  37.59 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  35.88 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  33.96 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  36.67 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  30.63 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  31.33 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  30.63 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  29.38 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  38.52 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5097  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5337  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4927  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5488  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  30.14 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4942  hypothetical protein  28.75 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  31.91 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  39.24 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  29.69 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  31.88 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1783  integral membrane protein-like protein  26.25 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1259  hypothetical protein  26.8 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1708  integral membrane protein-like protein  31.54 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3602  VanZ family protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  35.62 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1724  integral membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  30.38 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0345  integral membrane protein-like protein  30 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  33.73 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1277  integral membrane protein  30.12 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  28.77 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  40.91 
 
 		 109 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>