22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3083 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  100 
 
 
159 aa  329  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  47.06 
 
 
154 aa  128  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  43.61 
 
 
160 aa  117  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  34.19 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  32 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  31.91 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  40.24 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0857  VanZ family protein  34.09 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.34815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1543  hypothetical protein  40.58 
 
 
132 aa  53.9  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.457301  normal  0.048285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  26.15 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  31.82 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  27.86 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  38.64 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  31.85 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  32.14 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  30.6 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1519  VanZ family protein  40 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000017636  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  27.27 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  43.14 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  31.17 
 
 
440 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  33.73 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1610  VanZ family protein  52 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>