13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1791 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  100 
 
 
124 aa  240  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2594  VanZ like protein  36.79 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  42.31 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  38.64 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  40.79 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  38.24 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  38.75 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  41.89 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  33.73 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  35.21 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3957  VanZ family protein  33.33 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  30.84 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  37.5 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>