17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2961 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  36.11 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  27.82 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  29.55 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3602  VanZ family protein  37.76 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3359  hypothetical protein  32.08 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  30.77 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  33.61 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  34.29 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  30.84 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  30.65 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  31 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  38.46 
 
 		 165 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  38.71 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  36.36 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  28.77 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  53.12 
 
 		 109 aa  40.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>