21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  100 
 
 
154 aa  310  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  47.06 
 
 
159 aa  141  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  44 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  30.46 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  33.55 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0857  VanZ family protein  31.78 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.34815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  30.57 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  31.63 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  44.19 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  30.77 
 
 
175 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  41.89 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  23.13 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  31.63 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  53.49 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  31.76 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  32.31 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  25.16 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  33.33 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  25.16 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  24.53 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  25.79 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>