29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0238 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  100 
 
 
157 aa  317  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  35.66 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  38.36 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  36.67 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  36.57 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  32.12 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  32.21 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  31.62 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  31.47 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  31.47 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  32.17 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  32.17 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  30.67 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5337  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5488  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4942  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4927  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5097  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  29.85 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  33.87 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  26.53 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  26.15 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  33.33 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0743  hypothetical protein  26.67 
 
 
190 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000269716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3359  hypothetical protein  33.71 
 
 
203 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1783  integral membrane protein-like protein  26.39 
 
 
176 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  24.66 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  38.3 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3602  VanZ family protein  38.16 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>