21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1783 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1783  integral membrane protein-like protein  100 
 
 
176 aa  354  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1724  integral membrane protein-like protein  90.7 
 
 
174 aa  298  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1708  integral membrane protein-like protein  48.65 
 
 
189 aa  151  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0345  integral membrane protein-like protein  44.51 
 
 
169 aa  134  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  26.25 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  43.04 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  30.97 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  29.14 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  25.17 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3778  hypothetical protein  26.59 
 
 
164 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5365  hypothetical protein  26.59 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  26.39 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5419  hypothetical protein  26.59 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  26.01 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5488  hypothetical protein  26.59 
 
 
161 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5337  hypothetical protein  26.59 
 
 
161 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4927  hypothetical protein  26.59 
 
 
161 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5097  hypothetical protein  26.59 
 
 
161 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5040  hypothetical protein  25.43 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4942  hypothetical protein  28.07 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  25.43 
 
 
161 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>