12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0165 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  59.84 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0145  hypothetical protein  65.25 
 
 		 135 aa  150  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  48.36 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0750  hypothetical protein  44.03 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  28.18 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  33.61 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  34.29 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  34.48 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  33 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  35.71 
 
 		 116 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  36.73 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>