19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1750 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  250  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.27 
 
 		 392 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  35.54 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002239  hypothetical protein  33.04 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00129  hypothetical protein  31.67 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  36.28 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  31.9 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1516  hypothetical protein  47.62 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00121071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  39.08 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  41.03 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  35.24 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  40.66 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  33.03 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  33.94 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  36.25 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  38.1 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1429  VanZ family protein  35.29 
 
 		 135 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  36.73 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>