34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1394 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  100 
 
 		 116 aa  230  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  57.39 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  41.67 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  35.45 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  35.14 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  39.68 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  35.44 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  32 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  35.16 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  35.29 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  31.08 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  40.54 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  35.79 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  34.74 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  32.22 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  35.79 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  35.79 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  35.79 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  31.65 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  34.74 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2594  VanZ like protein  33.33 
 
 		 195 aa  43.5  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  34.74 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  34.74 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  36.25 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  34.74 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  32.26 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  33.77 
 
 		 141 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  30.23 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  30.3 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1489  VanZ family protein  35.29 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  34.83 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>