20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4466 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  237  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  32.5 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  34 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  40 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002239  hypothetical protein  32.04 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2623  VanZ like protein  39.08 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  35.9 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  39.19 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1678  hypothetical protein  34.44 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00129  hypothetical protein  33.01 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  42.42 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  38.27 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  36.04 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  36.11 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  29.63 
 
 
139 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  41.18 
 
 
142 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  43.33 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  39.47 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0222  hypothetical protein  39.39 
 
 
120 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>