27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0813 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  45.54 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  45.54 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2981  VanZ family protein  46.51 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.668765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  38.2 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  37.23 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  35.48 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  36.54 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0222  hypothetical protein  31.78 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0382  hypothetical protein  34.62 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  36.46 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1678  hypothetical protein  36.14 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  32.76 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  32.61 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  31.19 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3249  VanZ family protein  37.62 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.727461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  35.38 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1003  hypothetical protein  31.96 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  34.62 
 
 		 134 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1815  hypothetical protein  28.44 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  38.75 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2761  hypothetical protein  37.65 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  33.96 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  31.86 
 
 		 120 aa  40.8  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  32.61 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  30.97 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  30.97 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>