13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3249 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3249  VanZ family protein  100 
 
 
132 aa  260  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.727461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7300  hypothetical protein  42.05 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3918  hypothetical protein  35.45 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  33.64 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  34.07 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  31.52 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  37.62 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  34.19 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0245  hypothetical protein  35.06 
 
 
110 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  34.12 
 
 
140 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  31.03 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>