21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2879 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  270  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  52.38 
 
 		 119 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  46.08 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  43.22 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  45.05 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  41.76 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  42.45 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  45.88 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  45.88 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  40.48 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  39.36 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  31.63 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  30.61 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  36.71 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1593  hypothetical protein  39.33 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3029  hypothetical protein  43.06 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3253  hypothetical protein  43.06 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.619631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  32.67 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  41.25 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3249  VanZ family protein  34.12 
 
 		 132 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.727461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7300  hypothetical protein  29.7 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>