21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1420 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  255  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  85.34 
 
 
178 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  40.83 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  45 
 
 
119 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  40.34 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  40.91 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  45.65 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  38.6 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  37.38 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  40.7 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  34 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  33.96 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1593  hypothetical protein  38.55 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  31.63 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  36.46 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3029  hypothetical protein  38.3 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3253  hypothetical protein  37.23 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.619631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  32.94 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>