23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4358 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  53.4 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  46.08 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  50.93 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  45.54 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  47.96 
 
 		 110 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  38.6 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  36.52 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  43.48 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  42.17 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3029  hypothetical protein  42.05 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3253  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.619631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  37.35 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  37.35 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1593  hypothetical protein  40.48 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  32.11 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  38.04 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  36.79 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  39.09 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  30.3 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  39.81 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7300  hypothetical protein  33.94 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>