23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1108 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  81.51 
 
 		 119 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  73.87 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  40.83 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  47 
 
 		 178 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  50.93 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  46.22 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  49.43 
 
 		 115 aa  87  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  49.43 
 
 		 115 aa  87  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  47.31 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  43.43 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  40.82 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1593  hypothetical protein  41.38 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  37.07 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3029  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3253  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.619631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  35.34 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  35.45 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  37.62 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  29.52 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7300  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3918  hypothetical protein  30.3 
 
 		 162 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0644787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>