21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1596 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  100 
 
 
178 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  85.34 
 
 
128 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  46 
 
 
119 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  47 
 
 
119 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  44.44 
 
 
121 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  38.18 
 
 
116 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  43.56 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  36.52 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  41.41 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  44.58 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  44.58 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  36.7 
 
 
118 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  36.19 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  37.35 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  30.61 
 
 
140 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  34.41 
 
 
97 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  32.67 
 
 
114 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1593  hypothetical protein  36.05 
 
 
117 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3029  hypothetical protein  30.77 
 
 
114 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  29.41 
 
 
115 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3253  hypothetical protein  29.67 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.619631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>