21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4898 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  270  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3253  hypothetical protein  53.41 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.619631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3029  hypothetical protein  53.41 
 
 
114 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  48.65 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  47.73 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  47.73 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  44.14 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  41.28 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  46.23 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  41 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  40.66 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  41.35 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  40.59 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  38.3 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  42.17 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  37.89 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1593  hypothetical protein  37.78 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  38.61 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  36.9 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  39.47 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  31.73 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>