17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1593 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1593  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  43.88 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  41.9 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  40.82 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  37 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  39.13 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  34.95 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  40.96 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  38.61 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  37.78 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3029  hypothetical protein  34.41 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.619631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  31.46 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  32.69 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>