23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5068 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  75 
 
 		 119 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  73.87 
 
 		 119 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  40.34 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  52.38 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  52.38 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  48.48 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  44.44 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  46.74 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  46.24 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  45.05 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  46.32 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1593  hypothetical protein  43.18 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  37.86 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3029  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3253  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.619631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  38.89 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  30.19 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3918  hypothetical protein  32.65 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  32.97 
 
 		 97 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>