15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3126 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  193  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  65.59 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  67.05 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  36.46 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  34.41 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  38.95 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  39.47 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  35.79 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  37.68 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  32.97 
 
 		 121 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  33.8 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  33.8 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  32.18 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  37.63 
 
 		 119 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>