13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5423 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  40.91 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  38.18 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  37.63 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  34.48 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  30.19 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  29.81 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  29.52 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  30.23 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  32.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>