22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1451 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  227  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  80.51 
 
 		 118 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3126  hypothetical protein  65.59 
 
 		 97 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1596  VanZ family protein  36.7 
 
 		 178 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1420  hypothetical protein  37.38 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1108  hypothetical protein  37.07 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5068  hypothetical protein  37.86 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2879  hypothetical protein  39.36 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1005  hypothetical protein  38.39 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2010  hypothetical protein  36.26 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0662  hypothetical protein  43.04 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1140  hypothetical protein  34.07 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.204309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1181  hypothetical protein  34.07 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3023  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3249  VanZ family protein  33.64 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.727461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  37.93 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4358  hypothetical protein  35.85 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3218  hypothetical protein  37.76 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3918  hypothetical protein  30.21 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  33.33 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5423  hypothetical protein  30.23 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.372258  normal  0.0567866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  36.78 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>