22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0107 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  249  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  52.7 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  41.98 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  47.56 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  35.51 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  38.2 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0222  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  31.08 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  39.6 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  29.9 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  34.65 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  44.93 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  33.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  28.18 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  44.29 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4898  hypothetical protein  30.93 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.422933  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  34.29 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  32.29 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  32.14 
 
 		 120 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  32.14 
 
 		 120 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>