27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0472 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  230  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  43.75 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  44.62 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  35.96 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  44.62 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  44.62 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  44.62 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  39.71 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  46.15 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  46.15 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  46.15 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  48.05 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  43.08 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  31.37 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  31.37 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  40 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  37.5 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  37.5 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  37.8 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  38.81 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  33.33 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  37.31 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0059  VanZ family protein  32.97 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.861846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  38 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  31.43 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>