25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3444 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  100 
 
 		 146 aa  301  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  79.34 
 
 		 121 aa  186  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  69.75 
 
 		 120 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  69.75 
 
 		 120 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  68.91 
 
 		 120 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  69.75 
 
 		 120 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  68.07 
 
 		 119 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  66.67 
 
 		 120 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  66.67 
 
 		 120 aa  174  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  69.75 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  174  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  63.85 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  65.83 
 
 		 120 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  67.57 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  65.38 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  58.26 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  33.64 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  32.81 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  44.29 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  41.18 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  30.95 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  28.7 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  41.94 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  40.24 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>