29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0810 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  100 
 
 		 120 aa  240  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  99.17 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  99.17 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  92.5 
 
 		 120 aa  227  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  89.92 
 
 		 119 aa  220  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  89.17 
 
 		 120 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  88.33 
 
 		 120 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  88.33 
 
 		 120 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  88.33 
 
 		 120 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  65.83 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  65.22 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  58.82 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  65.49 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  63.03 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  62.73 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  58.47 
 
 		 120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  36.78 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  37.5 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  42.47 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  37.5 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  31.33 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  35.79 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19790  hypothetical protein  31.11 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  45.9 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  35.71 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20130  hypothetical protein  33.66 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1288  hypothetical protein  43.16 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.776572  normal  0.463218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>