12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20130  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  308  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19790  hypothetical protein  39.78 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1288  hypothetical protein  42.06 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.776572  normal  0.463218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  33.66 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  33.66 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  33.66 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0437  hypothetical protein  33.01 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  32.67 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>