25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1288 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1288  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  231  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.776572  normal  0.463218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20130  hypothetical protein  42.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  43.16 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  43.16 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  43.16 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3952  VanZ family protein  47 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  40.59 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  39.6 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  39.6 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  40.2 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19790  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5688  VanZ family protein  43.62 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  40 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  34.29 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  35.11 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  35.78 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  32.32 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  37.23 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  34.04 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  34.48 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  41.1 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  34.83 
 
 		 140 aa  42  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  32.5 
 
 		 139 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>