31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2558 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  58.47 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  60.33 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  58.47 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  57.63 
 
 		 120 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  58.47 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  58.47 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  56.78 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  55.93 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  55.93 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  55.93 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  55.93 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  56.64 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  55.65 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  52.99 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  53.39 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  32.5 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  31.91 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  37.65 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  34.52 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  38.57 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  38.27 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  39.71 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  46.55 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  30.23 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0059  VanZ family protein  37.38 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.861846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  38.75 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  37.5 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0222  hypothetical protein  29.29 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  29.82 
 
 		 129 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>