29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3534 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  100 
 
 		 120 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  99.17 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  99.17 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  98.33 
 
 		 120 aa  239  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  89.08 
 
 		 119 aa  222  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  90 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  90 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  89.17 
 
 		 120 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  85.83 
 
 		 120 aa  215  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  68.91 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  59.66 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  66.67 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  64.35 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  66.39 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  60 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  55.93 
 
 		 120 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  37.21 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  31.97 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  34.04 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  31.33 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19790  hypothetical protein  30.49 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  43.94 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  42.65 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  44.26 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  34.74 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  35.71 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  31.86 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>