34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0484 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  58.43 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  47.06 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  37.72 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  45.95 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  35.45 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  45.45 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  40.38 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  42.22 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  36.19 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  44.29 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  42.47 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2623  VanZ like protein  35.96 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  45.45 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  45.45 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  45.45 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  35.14 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  43.94 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  41.67 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  43.94 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  43.94 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  32.71 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  36.08 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  42.42 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  39.24 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  32.61 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  43.28 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  26.17 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1202  hypothetical protein  37.88 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.78098  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  41.03 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1429  VanZ family protein  39.19 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>