29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0817 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  100 
 
 		 119 aa  240  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  90.76 
 
 		 120 aa  224  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  90.76 
 
 		 120 aa  224  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  89.08 
 
 		 120 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  90.76 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  88.24 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  88.24 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  89.92 
 
 		 120 aa  220  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  87.39 
 
 		 120 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  68.07 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  65.22 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  60.5 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  63.96 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  63.87 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  60.91 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  58.47 
 
 		 120 aa  141  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  35.63 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  37.89 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  32.98 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  26.73 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  36.08 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  35.79 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  42.65 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0145  hypothetical protein  32.99 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  31.76 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  32.76 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  39.34 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19790  hypothetical protein  32.1 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>