31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0731 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  67.57 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  67.57 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  67.57 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  66.67 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  67.57 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  66.37 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  65.49 
 
 		 120 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  63.96 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  63.96 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  63.96 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  61.26 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  60.18 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  64.86 
 
 		 121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  56.64 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  56.64 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  37.72 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  32.71 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  33.33 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  30.19 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  33.72 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  36.84 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  36.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  40.32 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  30.3 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0059  VanZ family protein  28 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.861846 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  33.64 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  31.31 
 
 		 129 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  29.41 
 
 		 134 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>