39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1313 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 120 aa  236  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  57.39 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  41.56 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  37.82 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  39.18 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  37.35 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  37.76 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  36.63 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  32.97 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  31.53 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  37.18 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  39.19 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  43.84 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  40.66 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  32.69 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  39.77 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  40.96 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  39.47 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2981  VanZ family protein  34.94 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.668765 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  36.96 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  36.96 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  36.96 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  36.96 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  39.78 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  36.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  42.86 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  36.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  36.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  38 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  28.21 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  41.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  37.18 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  40.23 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  33.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  30.23 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1489  VanZ family protein  37.68 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  31.52 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>