17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1638 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  43.36 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  44 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  40.45 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  41.98 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  35.19 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3428  VanZ family protein  39.29 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0239273 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  35.54 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  35.54 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  40.91 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.54 
 
 		 392 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  31.76 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  36.11 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2761  hypothetical protein  35.87 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00129  hypothetical protein  42.03 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>