14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0802 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  263  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  98.55 
 
 		 138 aa  259  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3428  VanZ family protein  49.17 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0239273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  45.54 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  31.09 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  32.48 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2761  hypothetical protein  34.65 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  35.24 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  36.84 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  33.66 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  33.68 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5688  VanZ family protein  36.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>